Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn1Q922Y1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms