Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b3Q921M3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b3Q921M3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms