Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TardbpQ921F2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms