Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Creb3l3Q91XE9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms