Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Setd3Q91WC0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms