Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms