Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd49Q8VE42 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd49Q8VE42 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms