Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms