Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Stx18Q8VDS8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx18Q8VDS8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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