Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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