Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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