Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms