Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fam20bQ8VCS3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms