Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms