Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg10Q8R1P4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms