Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc137Q8R0K4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc137Q8R0K4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms