Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sf3b4Q8QZY9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms