Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vrk3Q8K3G5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vrk3Q8K3G5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vrk3Q8K3G5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vrk3Q8K3G5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vrk3Q8K3G5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vrk3Q8K3G5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vrk3Q8K3G5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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