Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccm2Q8K2Y9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms