Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrnp27Q8K194 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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