Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FgbQ8K0E8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FgbQ8K0E8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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