Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn3Q8K045 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms