Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms