Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc28bQ8CEG5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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