Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrif1Q8CDD9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms