Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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