Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp20Q8C6M1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp20Q8C6M1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp20Q8C6M1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp20Q8C6M1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp20Q8C6M1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms