Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q3

Ttc34, Tetratricopeptide repeat protein 34, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc34Q8C0Q3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc34Q8C0Q3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc34Q8C0Q3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc34Q8C0Q3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ttc34Q8C0Q3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc34Q8C0Q3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc34Q8C0Q3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc34Q8C0Q3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc34Q8C0Q3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms