Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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