Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms