Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8BP99 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q8BP99 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BP99 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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