Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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