Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubgcp5Q8BKN5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms