Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtaQ8BJU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtaQ8BJU0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtaQ8BJU0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms