Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms