Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms