Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms