Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms