Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc28Q80XJ3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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