Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms