Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttc29Q80VM3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttc29Q80VM3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ttc29Q80VM3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc29Q80VM3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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