Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NischQ80TM9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms