Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms