Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo1Q7TT28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms