Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms