Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk38lQ7TSE6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk38lQ7TSE6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms