Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms