Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf139Q7TMV1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf139Q7TMV1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms