Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms