Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SynmQ70IV5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms